1930年10月25日，工农革命军第一师团的部队在敌饶包围封锁中突围了出来，由于起义的影响，日本的军队开始全国的大概规模的调动吗，这时的日本军队已经不能对着周亦云的部队进行围剿，他需要应对2各个地区的情况，但是也让部队赢得了喘息之际，，
，第一师团参谋部长站了起来在临时搭建的主席台上对着下面到：“大阪笠置战役战果统计歼敌第16师团第33联队2324人（含联队长山田常太自决），俘虏745人（经教育后，412人自愿加入革命军），缴获三八式步枪1800余支、机枪32挺、山炮6门、弹药40吨，敌军溃逃：约850人，接着停顿了片刻道：“我军伤亡，牺牲412人（党员占比47%），负伤543人（含102名重伤员）”
“安置情况：重伤员分散安置于周边23个村庄，由地下党组织与村民共同照料由于情况紧急大部分的伤员都被师团部出钱，安放在了周边的村子，由村民治疗，其中包括了中野等人，在伤愈归队后在回归部队。”
在会议进行的过程中周亦云做了工农革命军的阶段性的报告。由于工农革命军是由日本旧时代的陆军第四师团改编过来的他具有日本反动派军队的弊端鉴于此腿
第一将工农革命军第一师团重新改编为4联队制度，淘汰意志不坚定者，保留精锐，提高战斗力，实行四联队制，全军精简整编后总兵力18,670人，每个联队下辖3个大队，3个中队。
在党组织建设上彻底确立确立支部建在中队上原则，每个中队设立党支部（党员不少于7人），队设党组（党员不少于3人），队有党员骨干，联队和大队设立党委，全军由前敌委员会的周亦云担任书记，由他同一指挥联队以上设兵务委员（与军事首长同级），大队设兵务教导员，中队设兵务指导员，实行双重领导的体制军事工作由军事首长决定，政治工作由兵务负全责。
第二进行军队民主化改革废除旧军队陋习，彻底取消打骂体罚制度，避免先入伍就可以大骂后入伍的几分钟的旧军队习气，官兵同灶同食（每日伙食标准统一），统一服装制式（取消军官特殊标识）。
废止旧式敬礼，改为革命军礼，建立士兵委员会，中队设士兵委员会（由士兵选举产生）他们的职权范围，监督中队经济开支，参与作战计划讨论，对军官提出质询，管理文化教育活动这个暂时无法实施
第三在思想政治建设上周亦云周亦云认为第一师团不能仅仅的作为u一直单纯的军队骂他还应该由更重要的责任，在玉桂寺会议上，周亦云批判了一些党员干部的单纯军事观点认为，大阪革命的成功会造成日本统治阶级的震动，在全国揭竿而起的的形势下，日本反动政府很快会被推翻、在大阪笠置伏击战中，整个第2联队第1大队第4中队极赌民主化导致了照御门神社的惨烈白刃战，让33联队差点未能全歼，所以我们一些崇尚极端民主化的同志应该立即认识之际的错误，吸取教训避免极端民主和非组织观点。
在会议上周亦云云还明确表示日本红军的军队性质的执行革命的政治任务的武装集团，必须服从日本共产党的领导。坚决不允许有以下克上的情况发生，他不断强调党对军队的绝对领导并且在一次重申了支部建在中队上，各级党组织需发挥核心作用。还规定党的会议须讨论军事工作，军事首长必须服从党的决议。
同时还规定了日本红军的三大任务打仗（军事斗争），筹款（经济保障），做群众工作（宣传、组织群众，建立政权），规定工农红军必须遵守三大纪律、八项注意，当然在内容上婴一些变化，但是3条铁律是没有任何变化的，一切行动听指挥，不拿群众一针一线，一切缴获要归公。
鉴于有很多的士兵，在行军过程中，或者宿营的时候悄悄的逃跑，虽然大部都被抓了回来但是周亦云鉴于日本的识字率很高，周亦云提出我们必须对着干部进行教育，不能让歪风邪气腐蚀军队，不愿意根着走的人和俘虏全部发放路费让他们回家。
党内批评要防止主观武断的批判要注重证据，强调教育为主、惩办为辅，并且要有充分的调查和报告，在会议的最后经过全体党员的投票，明确为工人农民而战的根本宗旨。
玉桂寺整编，构成了政治建军的基石，解决了农村环境下党的建设问题，通过思想建党，确保以农民为主的党员队伍的无产阶级先进性，为革命胜利提供保障
从此在共产党的领导下日本出现了一支历史上没有出现过的新型人民军队，为农村包围城市道路奠定组织基础，玉桂寺整编也有效解决了在日本反动派异常强大的时候，日本工农红军的前进的道路。